Actualmente se han activado los siguientes comités:
- Comité Codex sobre Aditivos Alimentarios
- Comité Codex sobre Residuos de Plaguicidas
- Comité Codex sobre Etiquetado de los Alimentos
- Comité Codex sobre Higiene de los Alimentos
- Comité Codex sobre Residuos de Medicamentos Veterinarios
- Comité Codex sobre Nutrición y Alimentos para regímenes especiales